Il San Diego-La Jolla Underwater Park, istituito nel 1971, protegge 6.000 acri di costa dove le foreste di kelp ancorano un sistema di barriera corallina vivente visibile dalla superficie. La Jolla Cove forma il confine settentrionale di questa riserva ecologica, un'area marina protetta di 533 acri dove la pesca e la raccolta sono proibite dal 2012. Le temperature dell'acqua variano da 17°C in inverno a 21°C a fine estate, sostenendo popolazioni tutto l'anno di Garibaldi, branzini calico e gli squali leopardo stagionali che si radunano nei canali di sabbia bassi tra aprile e novembre. Sette grotte marine punteggiano le scogliere di arenaria tra La Jolla Cove e La Jolla Shores, scavate nel corso dei millenni dall'azione delle onde contro la formazione di arenaria di Torrey dell'era dell'Eocene. La Sunny Jim Cave, l'unica caverna accessibile via terra, richiese 456 gradini scavati a mano nel 1902. Le restanti grotte, tra cui la White Lady e la Cathedral di 200 piedi, sono raggiungibili solo in kayak o nuotando dalla riva. Queste caverne creano pozze di marea dove i pesci giovani si riparano dai predatori e le alghe sostengono le colonie di invertebrati. Gli operatori del tour di snorkeling a La Jolla Shores partono dalla spiaggia protetta di Kellogg Park, dove l'ingresso in acqua bassa e la visibilità costante rendono il sito ideale per gli snorkelisti alle prime armi. La volta di kelp inizia a 50 metri dalla riva, ancorata al substrato roccioso da ramificazioni che sostengono intere reti alimentari. Le escursioni guidate navigano lungo le barriere coralline esterne dove i damigella Garibaldi, il pesce marino simbolo della California, difendono i territori di nidificazione tutto l'anno. L'aggregazione di squali leopardo, documentata dai ricercatori dello Scripps Institution dal 2015, raggiunge il picco tra giugno e settembre, quando le femmine incinte cercano acque basse più calde. Itinerari combinati in kayak e snorkeling accedono a entrambi gli ambienti in un'unica uscita. I pagaiatori entrano nelle grotte marine durante le finestre di mezza marea, quando l'altezza del soffitto e le correnti permettono un passaggio sicuro. Dopo essere approdati in calette appartate, i partecipanti fanno snorkeling lungo il perimetro di kelp dove la visibilità supera spesso i 20 piedi nelle mattine calme. Queste esperienze di tour di snorkeling a La Jolla Shores operano sotto permesso della divisione Shoreline Parks della città e aderiscono ai regolamenti della riserva marina che vietano di toccare o disturbare la fauna selvatica.